Originaire d’Hauteville-Lompnes, Amélie Goudjo découvre le handball au collège Sixdenier et ses qualités sont rapidement détectées. A 18 ans, elle part pour l’ASUL Vaulx-en-Velin qui évolue en Première Division (D1F). En 2001, elle profite d’une indisponibilité sportive pour réussir avec mention Bien son DESS de sociologie en développement local.
Le 8 mai 2005, elle connait sa première sélection en équipe de France lors d’un match amical face à l’équipe de Roumanie à Lyon. Elle sera ensuite sélectionnée en décembre pour disputer le Championnat du monde en Russie où la France termine à la 12e place.
À l’issue d’une saison à nouveau remarquable, elle décide de poursuivre sa carrière en Espagne. En 2009, elle remporte son premier titre senior: la Coupe de la Reine (Coupe d’Espagne). En juin, elle est rappelée en équipe de France et participe activement à la qualification de la France pour le Mondial 2009 en Chine. Elle est également retenue pour les Jeux Méditerranéens 2009. Son expérience, ses qualités personnelles et une très bonne connaissance de la plupart de ses coéquipières conduisent à la désigner comme la capitaine de l’équipe de France. Elle participe à sa troisième finale de la saison et conduit ses troupes à la médaille d’or.
La reconnaissance tant méritée pour cette joueuse exceptionnelle, tant sur le plan technique que sur celui des relations humaines au sein du groupe, se confirme en cette année 2009. Elle devient vice-championne du monde de handball avec l’équipe de France et trouve un éclairage médiatique conforme à ses qualités.
Au championnat d’Europe 2010 en Norvège, elle se retrouve à la tête d’une équipe de France retrouvée qui signe cinq victoires consécutives pour terminer à une prometteuse cinquième place.
En décembre 2011, aux championnats du monde au Brésil, elle conduit l’équipe de France jusqu’à la finale.
Elle conduit l’Équipe de France à la qualification pour l’Euro 2012, qui l’écarte de la sélection aux Jeux Olympiques de Londres, sans lui fournir la moindre explication. Très rapidement, le nouveau sélectionneur national, Alain Portes, la rappelle dans le groupe qui doit préparer le championnat du monde 2013 organisé en Serbie. Elle participera à ses 4èmes championnats du monde.
Le 26 mars 2014, en Islande, lors d’un match qualificatif à l’Euro, elle fête sa 100e sélection sous le maillot des bleues.
En septembre 2015, elle décide de mettre un terme à sa carrière sportive. Elle devient alors consultante pour la télévision.
